2020年的新冠肺炎疫情重创全球旅游业，携程受到严重影响，孙洁当机立断，与梁建章一起带领携程在危难中克服种种苦难，以实际行动展现了企业的责任和担当：10亿元的“伙伴基金”以及100亿元的“危信贷”，为平台和商业提供资金支持；投入10亿元的“旅游复兴V计划”复苏基金提振新冠肺炎疫情后的旅游经济。第三季度，携程的净营业收入为55亿元，环比增长73%，经营性利润率达到24%，位居全球上市旅企第一。得益于新冠肺炎疫情的有效控制以及跨省游的恢复，携程的国内主营业务收入及环比增长均超过两位数。

携程十分注重为女性员工创造机会，其高管团队有三分之一是女性。在2020年《财富》MPW女性峰会上，孙洁表示公司会为女性员工提供一系列独有的福利，包括为孕妇报销打车费用，以及为希望冷冻卵子的员工提供资助。